微生物データベースの将来に関するフォーラム
2012年5月28日（月）10：00〜
会場　玉川大学講堂　（小田急線「玉川学園前」駅より徒歩3分）

微生物資源とそのデータについて、産官学それぞれの立場から国内外の現状や課題が発表され、将来の方向性について討論されます。是非ご参加ください。


16：10-16:50　　西　達也　（株式会社ジナリス　代表取締役社長）
「産業界の微生物ゲノムデータベースに求められるもの」
（Requirements for industrial microbial genome database）

事前参加登録は　5月18日（金）まで。
プログラム・お申込など　詳しくはこちらを御覧ください。

Oxford Nanopore Technologies (Oxford Nanopore) が、今年2月17日にナノポアシーケンサーを今年中に発売することを発表したが、そのシーケンシング技術を科学的に裏付けるデータや論文を発表していない。一方、AkesonらのグループとGundlachらのグループがそれぞれタンパク質ナノポアを用いてシーケンシングが行えることを実証した論文をNature Biotechnology誌4月号に発表した。今回のGOクラブでは、これら論文のエッセンスを紹介するとともに、論文のデータからナノポアシーケンシング技術の欠点について考察してみたいと思う。

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前回のGOクラブで、シリコンバレーで活動しているQuantapore Inc. (Quantaporeと略す)を紹介したが、今回のGOクラブでは、Quantaporeが開発を進めているナノポアシーケンシング技術である Nanopore Energy Transfer Sequencing（NET シーケンシング）技術の概要について紹介する。また、第１世代シーケンシング技術であるサンガー法の将来についても考察してみたい。

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NGS現場の会 第2回研究会　2012年5月24（木）－　25日（金）
会場：ホテル阪急エキスポパーク（大阪府吹田市）

次世代シーケンシングに関わる研究者、およびこれから導入を目指している研究者や技術者が、具体的な方法論や技術、そして分野の方向性などをオープンな雰囲気で議論することを目的とした研究会です。

弊社からは解析事例紹介ポスターやブース展示の他に、講演も担当します。

2日目（25日）オーラルセッション【ツールセッション】
「次世代ゲノム解析における傾向と対策〜目的に合わせた道具選び〜」
上村　泰央（株式会社ジナリス　ゲノム解析事業部長）
（要旨はこちら：　http://ngs-field.org/meeting/2nd/parallel/tool）

4月9日から20日まで、本会参加の追加募集が行われています。
是非この機会を逃さず、お早めにお申込下さい。
http://ngs-field.org/meeting/2nd
*学生参加者への参加費免除枠も若干名まだ残っているようです （4/11現在）

大阪で皆様とお会いできるのを楽しみにしております。

　米国では、2001年にクリントン大統領がナノテク研究を国家の戦略目標として重点化してきたが、その成果として次世代シーケンサーの進歩が加速化されている。日本でも欧米の研究の進展に合わせて、ナノテク研究に多くの予算が配分されているが、次世代シーケンサーの開発が進んでいない。今回のGOクラブでは、次世代シーケンサー開発におけるナノテクの役割をまとめるとともに、日本の未来を考えるために、次世代シーケンサーのような革新的な製品を誕生させるための条件を考察してみたい。

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　Illuminaは今年1月10日に「Illumina HiSeq2500の発売とMiSeqのアップグレード」を発表したが、その後に「MiSeqを使った小規模シーケンシングキットやガン遺伝子シーケンシングパネル」についても発表した。今回のGOクラブでは、Barclays Capital Global Healthcare ConferenceでのIlluminaの発表（2012年3月14日）などをもとに、これら新製品について紹介し、Ion Torrentシーケンサーとの比較について考察してみたい。

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  Genia Technologies, Inc.（Genia）のCEOであるStefan Roever氏のインタビュー（日時・場所：今年2月5日、4th Personalized Medicine World Conferenceの会場）を聞き、Geniaのナノポアシーケンサーに魅力を感じた。Oxford Nanoporeの発表が2月17日であったので、その12日前にこのインタビューが行われたことが興味深い。Roever氏は、「Ion Torrent が開発したCMOS技術」と「ナノポア」を合体させた１分子電気的検出（single molecule, electrical detection）シーケンサーが、「第４世代」でなく、「最終世代シーケンサー」であると主張している。今回のGOクラブでは、Roever氏のインタビューに基づいて、Geniaが開発を進めている新しいナノポアシーケンシング技術を紹介する。

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　2月6日付のＧＯクラブで、「次世代シーケンサーの未来」としてナノポアシーケンサーに対する多数の予言と期待を述べたが、それらをすべて満たすOxford Nanopore Technologies（以下、Oxford Nanoporeと略す）のナノポアシーケンサーが、わずか11日後に発表された。驚くべき衝撃である。ＧＯクラブでもOxford NanoporeのGridIONシーケンサーについて紹介したことがあるが、そのGridIONシーケンサーの性能は驚くべきものであった。さらに衝撃的なデビューは、MinIONと呼ぶシーケンサーである。今回のＧＯクラブでは、Oxford Nanoporeが今年後半に発売するこれら２種類のシーケンサーを紹介する。

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　本記事の著者が次世代シーケンシング技術に出会ったのは約15年前である。当時は「円盤状のマイクロ流路技術によるサンガーシーケンシング」、 「Lynx Therapeuticsのマイクロビーズ状のシーケンシング（Massively Parallel Signature Sequencing）」、「ハイブリダイゼーションチップを用いたのシーケンシング法」などの開発が進んでいた。今回のGOクラブでは、次世代シーケン シング技術の誕生と進歩を振り返るとともに、次世代シーケンサーの未来を考察してみたい。

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　新年明けてから、「Ion Torrentの新シーケンサーProton Sequencerの発売」と「Illumina  HiSeq2500 Sequencerの発売」 という２つの大きなニュースが発表された。Ion Torrent は、"The Chip Is The Machine."と謳っていたので、新シーケンサーの発売は当面ないと思っていた。したがって、今回のIon Torrent Proton Sequencerの発売は意外であった。今回のGOクラブでは、Proton SequencerとPGM Sequencerを比較して、それぞれの用途について考察してみたい。

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