メタゲノム解析の目的としては、環境中の微生物群集から有用新規酵素を探索したり、腸内・口腔環境や土壌・水質に棲む微生物群集 の存在比を調査したりとさまざまです。
ジナリスでは、長浜バイオ大学の池村淑道教授らが開発した「DNA配列の連続塩基配列の頻度情報をもとに、改良型自己組織化マップ法 （BL-SOM法）に よりDNAを分類する技術」を用いた、メタゲノム解析サービスを開始いたしました。 次世代シーケンシング受託サービスと組み合わせて、配列決定からデータ解析まで、一連の解析を実施いたします。

メタゲノム解析には、より長いリード長の出力が有効です。そのため、Roche/454 FLX TitanumまたはABI 3730xlのご利用がお薦めです。 解析目的に応じて、ゲノムDNAサンプルもしくは16S rRNA領域の増幅DNAが必要になります。 バーコードタグ（MID)をシーケンシングアダプターに導入することにより、複数サンプルをスライド１区間に混ぜて解析することが出来ます。

目的に応じて、以下のデータ解析が可能です。
ゲノムアノテーション
大量のメタゲノムDNAデータをもとに、ジナリスアノテーションシステム（GAS）を用いて翻訳領域の予測とアノテーションを行います。 新規酵素探索に有効です。解析データ（Excel, HTML, GenBank形式）をお客様に提供いたします。

16S rRNAアノテーションによる生物種分類
16S rDNA領域の増幅サンプルを大量に読んだ配列データをもとに、既知微生物16S rRNA配列データベースに対して相同性解析を行い 各リード配列の由来生物種を同定します。その結果を生物種ごとに集計することにより、サンプル中の微生物群の存在比を推定すること ができます。
16S rRNAメタゲノム解析について、詳しくはこちら。

BL-SOM法による生物種分類
BL-SOMメタゲノム解析システムを用いて大量のメタゲノム配列データを解析し、連続塩基配列の頻度情報をもとに、各DNA断片が由来した 生物種を予測することができます。任意のDNA配列に対して有効であり、既知配列と相同性のない、または相同性が低いDNAについても 分類を行えるという特長があります。サンプル中の微生物群の存在比を推定することができます。