• 454FLX TitaniumかIllumina をお選びいただけます。

• ゲノムサイズ～15Mb以下の場合はIlluminaのペアエンドライブラリ（リード長75～100 bp）がお手頃価格です。
• ゲノムサイズ～15Mb以上の配列決定、またはコンティグ数を少なくするには、454FLX Titaniuｍ（リード長～400 bp）がお薦めです。

• ライブラリの種類やシーケンサを組み合わせたハイブリッド解析も承ります。
• バーコードタグを用いた複数サンプルの解析も可能です。
• ご準備頂くサンプル：ゲノムDNA　10～30 μg
• 納品物：配列データ（DVD、HDDなど）

• シーケンサ付属のソフトや各種アセンブリ解析ツールを活用
• Illuminaのデータを使ったアセンブリの場合は、当社独自のデータトリミング・フィルタリングアルゴリズムを用いて、 より精度の高いゲノム配列を得ることができます。
• ライブラリの種類やシーケンサを組み合わせたハイブリッド解析も承ります。

原核微生物
アセンブリの結果、得られたコンティグ配列を対象に、当社独自開発のGenaris Annotation System (GAS)や　Genaris Contig Analyzer(CONAN)などを用いて、 遺伝子同定、タンパク機能予測、遺伝子産物カテゴリー予測など様々なアノテーションを付与します。

GASの結果の一部(高精度翻訳領域同定、tRNA/rRNA遺伝子同定、遺伝子産物名、遺伝子シンボル予測)をGiNeSに登録し検索可能にする便利なサービスも始めました！ (GAS4GiNeS遺伝子アノテーション解析）

真核微生物
近縁種ゲノム、転写産物配列データ、遺伝子データベース等を活用し、エクソンーイントロン、CDS、RNA遺伝子領域を予測します。また、当社独自開発の 真核生物ゲノムアノテーションシステムGAV-Eを用いて、アノテーション解析結果が閲覧可能な環境を構築します。

その他
お客様のご要望にお応じて、各種アノテーション解析を実施いたします。
各種アノテーション解析について、詳しくはこちら。

フェーズⅠフィニッシング
通常、各コンティグ末端から２～３回のプライマーウォーキングによりGap Filling（スキャフォールド内）を行います。 なお、ドラフトゲノム配列が非常に多くの数のContig配列を含む（Scaffold配列中に多数のギャップ配列を含む）場合には、 Illumina ペアエンドのデータを足すことにより、多くのギャップを埋めることが出来ます。 または、Fosmid libraryを作製し、サンガー法により配列決定を行い、 FLX Titaniumシーケンサーのデータとコアセンブルを実施した後、Gap Fillingを行うこともできます。
フェーズIIフィニッシング
ゲノムサイズや複雑さによって様々な手法を用いて、スキャフォールド同士を連結させます。

Beckman Coulter Genomics社は、サンガー法によるサーモンゲノムの配列決定など、複雑なゲノムの解読においても経験豊富です。

効率的にデータを解析していただくためには、データベース化したシステムが不可欠です。

ジナリスでは、オンライン上で簡単にお使いいただけるゲノム解析クラウドサービスGiNeS とお客様のご要望に応じて自由にカスタマイズできる統合ゲノム解析サーバGiGS の2種類のシステムをご提供します。