統合ゲノム解析サーバ GiGS（ギグス）
Genaris integrated Genome Server |
 |
GiGSの特徴
カスタマイズ可能－パワフルなゲノム解析環境
|
基本機能
ゲノムデータを使いこなそう
NCBIなどで公開されているゲノムデータや、お客様独自で解析したゲノム・トランスクリプトームなどの配列／アノテーションデータをGiGSに登録します。
リレーショナルデータベースと直感的なユーザーインターフェイスで強力な検索・分析環境が構築できます。カスタマイズも承ります。
|
 |
オプション：変異解析機能
変異（SNP）データの総合的な比較・分析環境
| ゲノムリシーケンス解析により得られた変異データをデータベースに格納し、様々な解析を可能にします。 例えば、ゲノム地図上で変異点を表示したり、機能遺伝子上の変異や、複数の変異株に共通の変異、 あるサンプル（群）に特異的な変異など、注目する変異を効率よくスクリーニングすることができます。 |
 |
オプション：発現解析機能
BL-SOMを使った発現遺伝子のクラスタリング
| 発現解析オプションを搭載したGiGSでは、mRNA-seqなど次世代シーケンサを用いた遺伝子発現解析データを扱えるようになります。 ゲノムビューワ上にサンプルごとのマッピング結果が表示されるだけでなく、発現パターンの類似性による遺伝子（RNA）のクラスターが作成され、 クラスターの検索、クラスターに属する遺伝子（RNA）の表示、発現のパターンに対する条件検索などを行うことができるようになります。 |
 |
in house BLAST/CD サーチ
機密データの解析はインハウス環境で
| NCBIなど公的な配列データベースに対する各種BLAST解析をローカルな閉じた環境で行うことができます。最新BLASTデータベースを自動的にアップデートする機能を有しているため、常に最新の配列情報にアクセスできます。 |
| NCBI CDDなど公的なタンパク配列ドメインデータベースに対するドメイン検索をローカルな閉じた環境で行うことができます。最新のデータベースを自動的にアップデートする機能を有しているため、常に最新のタンパク配列ドメイン情報にアクセスできます。 |